Всероссийский научно-исследовательский институт физиологии, биохимии и питания животных – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный научный центр животноводства – ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
В связи с проведением селекции крупного рогатого скота по признаку жирномолочности, актуальным является поиск ДНК-маркеров, ассоциированных с содержанием жира в молоке коров. Одним из таких генов-кандидатов является ген agpat6, кодирующий глицерол-3-фосфат ацилтрансферазу 6 (AGPAT6). Известен однонуклеотидный полиморфизм rs211250281 (g27: 36520069 G/T), который расположен в промоторной области agpat6 и ассоциирован с содержанием жира в молоке коров. Целью данной работы было провести оценку частоты встречаемости полиморфизма rs211250281 у разных пород крупного рогатого скота отечественной селекции. Исследования проводились на образцах ДНК коров восьми пород: айрширской (n=56), абердин-ангусской (n=27), герефордской (n=33), якутской (n=41), ярославской (n=48), калмыцкой (n=49), костромской (n=38) и чёрно-пестрой голштинизированной (n=49). Генотипирование коров проводили методом ПЦР-ПДРФ. Обнаружены низкие значения частоты встречаемости генотипа TT гена AGPAT6 (rs211250281) у коров исследованных пород с высокими показателями жирномолочности
1. Баранов А. В., Парамонова Н. Ю., Баранова Н. С. и др. Костромская порода крупного рогатого скота в новом столетии: состояние и перспективы (обзор). // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2019. Т. 20. № 6. C. 533-547.
2. Болгов А.Е. Всемирный конгресс айршироведов. // Сельскохозяйственные вести. 2010. № 1. С. 9-11.
3. Коновалов А.В., Mоскаленко Л.П. Оценка молочной продуктивности коров ярославской и айрширской пород в товарном стаде. // Вестник АПК Верхневолжья. 2009. № 4. С. 23-26.
4. Лукьянов В.Н. Формирование мясной продуктивности скота симментальской и черно-пестрой пород и помесей, полученных при скрещивании с быками британской и французской селекции: автореф. дисс…д.с.-х.н. М., ТСХА, 2018. 45 с.
5. Нармаев М.Б. Калмыцкий скот и его совершенствование. Элиста: Калмыцкое государственное издательство, 1963, 238 c.
6. Новоселова К.С., Холодова Л.В. Молочная продуктивность и генетический потенциал айрширского скота в Республике Марий Эл. // Учёные записки Казанской государственной академии ветеринарной медицины им. Н. Э. Баумана. 2015. Т. 224. № 4. C. 158-163.
7. Соловьёва О. И. Чёрно-пёстрая порода. // Большая российская энциклопедия, М. 2017. Т 34. C. 486.
8. Тамарова Р.В. Создание высокопродуктивных племенных стад ярославской породы крупного рогатого скота. // Вестник АПК Верхневолжья. 2013. № 1. С. 31–35.
9. Филинская О.В., Ивачкина О.В. Характеристика показателей лактации коров ярославской породы. // Вестник АПК Верхневолжья. 2017. № 4. C. 12-17.
10. Abdolmohammadi A., Atashi H., Zamani P., Bottema C. High resolution melting as an alternative method to genotype diacylglycerol O-acyltransferase 1 (DGAT1) K232A polymorphism in cattle Czech. // J. Anim. Sci. 2011. Vol. 56. nr 8. P. 370-376.
11. Babii A.V., Arkhipova A.L., Andreichenko I.N., Brigida A.V., Kovalchuk S.N. A TaqMan PCR assay for detection of DGAT1 K232A polymorphism in cattle. //AIMS Agriculture and Food. 2018. Vol.3. nr 3. P. 306-312.
12. Beigneux A. P., Vergnes L., Qiao X. et al. Agpat6 – a novel lipid biosynthetic gene required for triacylglycerol production in mammary epithelium. // J. Lipid Res. 2006. Vol. 47. nr 1. P. 734-744.
13. Bionaz M., Loor J. J. ACSL1, AGPAT6, FABP3, LPIN1, and SLC27A6 are the most abundant isoforms in bovine mammary tissue and their expression is affected by stage of lactation, // J. Nutr. 2008. Vol. 138. P. 1019-1024.
14. Bionaz M., Vargas-Bello-Pérez E., Busato S. Advances in fatty acids nutrition in dairy cows: from gut to cells and effects on performance. // J. Anim. Sci. Biotechnol. 2020. Vol. 11. nr 1. P. 110.
15. Cai Z., Dusza M., Guldbrandtsen B., Lund M.S., Sahana G. Distinguishing pleiotropy from linked QTL between milk production traits and mastitis resistance in Nordic Holstein cattl. // Genet. Sel. Evol. 2020. Vol. 52. nr 1. P. 19.
16. Cai Z., Guldbrandtsen B., Lund M. S., Sahana G. Dissecting closely linked association signals in combination with the mammalian phenotype database can identify candidate genes in dairy cattle. // BMC Genet. 2018. Vol. 19. P. 30.
17. Cole L.J., Johansson I. The yield and composition of milk from aberdeen-angus cows. // J. Dairy Sci. 1933. Vol. 16. P. 565-580.
18. Daetwyler H. D., Capitan A., Pausch H. et al. Whole-genome sequencing of 234 bulls facilitates mapping of monogenic and complex traits in cattle. // Nat. Genet. 2014. Vol. 46. P. 858-865.
19. Dekkers J.C. Ap plication of genomics tools to animal breeding. // Curr. Genom. 2012. Vol. 13. nr 3. P. 207-212.
20. Han B., Yuan Y., Liang R., Li Y., Liu L., Sun D. Genetic Effects of LPIN1 Polymorphisms on milk production traits in dairy cattle // Genes (Basel). 2019. Vol. 10. nr 4. P. 265.
21. Heather J.M., Chain B. The sequence of sequencers: the history of sequencing DNA. // Genomics. 2016. Vol. 107. nr 1. P. 1-8.
22. Jensen R. G. The composition of bovine milk lipids: January 1995 to December 2000. // J. Dairy Sci. 2002. Vol. 85. nr 2. P. 295-350.
23. Khan M. Z., Ma Y., Ma J. et al. Association of DGAT1 with cattle, buffalo, goat, and sheep milk and meat production traits. // Front. Vet. Sci. 2021. Vol. 8. P. 712470.
24. Komisarek J., Michalak A. A relationship between DGAT1 K232A polymorphism and selected reproductive traits in Polish Holstein-Friesian cattle. //Anim. Sci. Pap. Rep. 2008. Vol. 26. P.89–95.
25. Kong H. S., Oh J. D., Lee J. H. et al. Association of sequence variations in DGAT 1 gene with economic traits in Hanwoo (Korea cattle). // Anim. Biosci. 2007. Vol. 20. P. 817–820.
26. Koopaee H. K., Koshkoiyeh A. E. SNPs genotyping technologies and their applications in farm ani-mals breeding programs. // Braz. Arch. Biol. Techn. 2014. Vol. 57. P. 87-95.
27. Littlejohn M. D., Tiplady K., Lopdell T. et al. Expression variants of the lipogenic AGPAT6 gene affect diverse milk composition phenotypes in Bos Taurus. // PLoS One. Vol. 9. nr 1. P. e85757.
28. Ma Y., Khan M. Z., Xiao J. et al. Genetic markers associated with milk production traits in dairy cattle // Agriculture. 2021. Vol. 11. P. 1018.
29. Näslund J., Fikse W. F., Pielberg G. R., Lundén A. Frequency and effect of the bovine Acyl-CoA: diacylglycerol acyltransferase 1 (DGAT1) K232A polymorphism in Swedish dairy cattle. // J. Dairy Sci. 2008. Vol. 91. P. 2127-2134.
30. Osorio J. S., Lohakare J., Bionaz M. Biosynthesis of milk fat, protein, and lactose:roles of transcriptional and posttranscriptional regulation. // Physiol. Genomics. 2016. Vol. 48. nr 4. P. 231-256.
31. Pausch H., MacLeod I. M., Fries R. et al. Evaluation of the accuracy of imputed sequence variant genotypes and their utility for causal variant detection in cattle. // Genet. Sel. Evol. 2017. Vol. 49. P. 24.
32. Strucken E. M., Bortfeldt R. H., Tetens J., Thaller G., Brockmann G. A. Genetic effects and correlations between production and fertility traits and their dependency on the lactation-stage in Holstein Friesians. // BMC Genet. 2012. Vol. 13. P. 108.
33. Tribout T., Croiseau P., Lefebvre R. et al. Confirmed effects of candidate variants for milk production, udder health, and udder morphology in dairy cattle. // Genet. Sel. Evol. 2020. Vol. 52. nr 1. P. 55.
34. Wolf M. J., Yin T., Neumann G.B. et al. Genome-wide association study using whole-genome sequence data for fertility, health indicator, and endoparasite infection traits in German Black Pied cattle // Genes (Basel). 2021. Vol. 12. nr 8. P. 1163.
35. Yu H., Zhao Y. et al. Effects of polymorphism of the GPAM gene on milk quality traits and its relation to triglyceride metabolism in bovine mammary epithelial cells of dairy cattle. //Arch. Anim. Breed. 2021. Vol. 64. P. 35-44.
36. Zimin A. V., Delcher A. L., Florea L. et al. A whole-genome assembly of the domestic cow, Bos taurus. // Genome Biol. 2009. Vol. 10. nr 4. P. 42.